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漾濞槭全基因組獲解析

媒體:科技日報  作者:趙漢斌
專業(yè)號:生物多多 2019/8/7 18:17:35

漾濞槭原產(chǎn)于云南蒼山西面的漾濞山谷,屬于槭樹科的楓屬植物。此屬植物在產(chǎn)糖、用材和觀賞方面都具有重要的價值,同時因其種群規(guī)模小、繁殖不良和棲息地退化面臨極高的滅絕風(fēng)險而備受關(guān)注。記者近日從中科院昆明植物研究所獲悉,該所近期已成功解析這個極小種群野生植物的全基因組。相關(guān)論文發(fā)表在國際期刊《GigaScience》上。

自2003年被發(fā)現(xiàn)以來,中科院昆明植物研究所極小種群野生植物綜合保護(hù)團(tuán)隊持續(xù)開展研究工作,明確了其野外種群數(shù)量、傳粉生物學(xué)與種子散布特征,以及物種遺傳樣性與種群結(jié)構(gòu)。今年以來,團(tuán)隊又完成了漾濞槭全基因組測序、組裝,獲得了近于染色體水平的高質(zhì)量全基因組,也是目前首例槭樹科植物的全基因組報道。

有意思的是,通過與葡萄的全基因組共線性分析顯示,與葡萄染色體相比,漾濞槭染色體中保留了大量祖先染色體成分,其地位或可替代葡萄成為無患子目染色體進(jìn)化分析最重要的參考基因組。

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